Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc55Q3UY51 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lrrc55Q3UY51 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc55Q3UY51 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc55Q3UY51 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc55Q3UY51 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 768.6 ms