Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mbd3l2Q3UXB0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd3l2Q3UXB0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms