Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clca4bQ3UW98 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clca4bQ3UW98 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clca4bQ3UW98 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clca4bQ3UW98 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clca4bQ3UW98 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms