Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D130052B06RikQ3UW13 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
D130052B06RikQ3UW13 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
D130052B06RikQ3UW13 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms