Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BB287469Q3UT53 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BB287469Q3UT53 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BB287469Q3UT53 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BB287469Q3UT53 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms