Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mindy4Q3UQI9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Mindy4Q3UQI9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mindy4Q3UQI9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mindy4Q3UQI9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms