Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zswim8Q3UHH1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zswim8Q3UHH1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zswim8Q3UHH1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zswim8Q3UHH1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Zswim8Q3UHH1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zswim8Q3UHH1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zswim8Q3UHH1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zswim8Q3UHH1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zswim8Q3UHH1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zswim8Q3UHH1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zswim8Q3UHH1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zswim8Q3UHH1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zswim8Q3UHH1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zswim8Q3UHH1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms