Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc177Q3UHB8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc177Q3UHB8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms