Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Yipf3Q3UDR8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf3Q3UDR8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yipf3Q3UDR8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yipf3Q3UDR8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms