Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Parp8Q3UD82 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Parp8Q3UD82 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Parp8Q3UD82 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Parp8Q3UD82 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Parp8Q3UD82 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Parp8Q3UD82 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Parp8Q3UD82 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Parp8Q3UD82 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp8Q3UD82 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 524.2 ms