Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Psmd1Q3TXS7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Psmd1Q3TXS7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Psmd1Q3TXS7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psmd1Q3TXS7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psmd1Q3TXS7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psmd1Q3TXS7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psmd1Q3TXS7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Psmd1Q3TXS7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psmd1Q3TXS7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psmd1Q3TXS7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psmd1Q3TXS7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Psmd1Q3TXS7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psmd1Q3TXS7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psmd1Q3TXS7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Psmd1Q3TXS7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Psmd1Q3TXS7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psmd1Q3TXS7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psmd1Q3TXS7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psmd1Q3TXS7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psmd1Q3TXS7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psmd1Q3TXS7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psmd1Q3TXS7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psmd1Q3TXS7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms