Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWH3

Pnrc1, MCG12570, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnrc1Q3TWH3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pnrc1Q3TWH3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pnrc1Q3TWH3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnrc1Q3TWH3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms