Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUA9

Pomk, Protein O-mannose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomkQ3TUA9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PomkQ3TUA9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PomkQ3TUA9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PomkQ3TUA9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PomkQ3TUA9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PomkQ3TUA9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PomkQ3TUA9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PomkQ3TUA9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PomkQ3TUA9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PomkQ3TUA9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PomkQ3TUA9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PomkQ3TUA9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PomkQ3TUA9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PomkQ3TUA9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms