Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
D17Wsu92eQ3TT38 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D17Wsu92eQ3TT38 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
D17Wsu92eQ3TT38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms