Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam172aQ3TNH5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam172aQ3TNH5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam172aQ3TNH5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam172aQ3TNH5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam172aQ3TNH5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms