Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp39Q3TIX9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp39Q3TIX9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp39Q3TIX9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp39Q3TIX9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms