Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2f1Q3THK3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2f1Q3THK3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Gtf2f1Q3THK3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2f1Q3THK3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2f1Q3THK3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms