Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmem104Q3TB48 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem104Q3TB48 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem104Q3TB48 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem104Q3TB48 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms