Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KncnQ307W7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KncnQ307W7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KncnQ307W7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms