Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3X8

Phactr1, Phosphatase and actin regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr1Q2M3X8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr1Q2M3X8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr1Q2M3X8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr1Q2M3X8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr1Q2M3X8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr1Q2M3X8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr1Q2M3X8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr1Q2M3X8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr1Q2M3X8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr1Q2M3X8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phactr1Q2M3X8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phactr1Q2M3X8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phactr1Q2M3X8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phactr1Q2M3X8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phactr1Q2M3X8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Phactr1Q2M3X8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Phactr1Q2M3X8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phactr1Q2M3X8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phactr1Q2M3X8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phactr1Q2M3X8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phactr1Q2M3X8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phactr1Q2M3X8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phactr1Q2M3X8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phactr1Q2M3X8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phactr1Q2M3X8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms