Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHK6

Gsdmc2, Gasdermin-C2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdmc2Q2KHK6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gsdmc2Q2KHK6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gsdmc2Q2KHK6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gsdmc2Q2KHK6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gsdmc2Q2KHK6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gsdmc2Q2KHK6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms