Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLK6

B3gnt4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt4Q1RLK6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B3gnt4Q1RLK6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B3gnt4Q1RLK6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3gnt4Q1RLK6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
B3gnt4Q1RLK6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt4Q1RLK6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms