Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmprss11cQ1JRP2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmprss11cQ1JRP2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmprss11cQ1JRP2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmprss11cQ1JRP2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmprss11cQ1JRP2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmprss11cQ1JRP2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms