Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samd12Q0VE29 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd12Q0VE29 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd12Q0VE29 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Samd12Q0VE29 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms