Protein–RNA interactions for Protein: Q07174

Map3k8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k8Q07174 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Map3k8Q07174 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Map3k8Q07174 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k8Q07174 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map3k8Q07174 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Map3k8Q07174 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map3k8Q07174 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms