Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah2Q06986 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah2Q06986 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah2Q06986 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms