Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tie1Q06806 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tie1Q06806 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tie1Q06806 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tie1Q06806 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tie1Q06806 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tie1Q06806 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tie1Q06806 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tie1Q06806 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tie1Q06806 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tie1Q06806 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tie1Q06806 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tie1Q06806 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tie1Q06806 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tie1Q06806 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tie1Q06806 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tie1Q06806 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms