Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1Q04750 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1Q04750 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top1Q04750 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1Q04750 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top1Q04750 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1Q04750 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1Q04750 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1Q04750 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1Q04750 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top1Q04750 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1Q04750 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1Q04750 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top1Q04750 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top1Q04750 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms