Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emx1Q04742 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Emx1Q04742 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Emx1Q04742 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emx1Q04742 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emx1Q04742 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Emx1Q04742 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emx1Q04742 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Emx1Q04742 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Emx1Q04742 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Emx1Q04742 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Emx1Q04742 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Emx1Q04742 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Emx1Q04742 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emx1Q04742 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Emx1Q04742 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emx1Q04742 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emx1Q04742 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Emx1Q04742 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emx1Q04742 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emx1Q04742 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Emx1Q04742 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Emx1Q04742 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Emx1Q04742 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Emx1Q04742 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Emx1Q04742 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Emx1Q04742 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Emx1Q04742 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms