Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hivep1Q03172 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hivep1Q03172 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hivep1Q03172 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hivep1Q03172 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms