Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gjb4Q02738 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb4Q02738 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb4Q02738 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gjb4Q02738 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gjb4Q02738 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gjb4Q02738 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjb4Q02738 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gjb4Q02738 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms