Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ascl1Q02067 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ascl1Q02067 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ascl1Q02067 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms