Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VcpQ01853 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VcpQ01853 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VcpQ01853 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VcpQ01853 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VcpQ01853 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VcpQ01853 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VcpQ01853 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VcpQ01853 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VcpQ01853 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VcpQ01853 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VcpQ01853 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VcpQ01853 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VcpQ01853 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VcpQ01853 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VcpQ01853 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VcpQ01853 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms