Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SeleQ00690 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SeleQ00690 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeleQ00690 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeleQ00690 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SeleQ00690 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SeleQ00690 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SeleQ00690 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SeleQ00690 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms