Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VldlrP98156 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VldlrP98156 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VldlrP98156 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VldlrP98156 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VldlrP98156 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VldlrP98156 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VldlrP98156 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VldlrP98156 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
VldlrP98156 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VldlrP98156 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VldlrP98156 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VldlrP98156 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VldlrP98156 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VldlrP98156 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VldlrP98156 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VldlrP98156 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VldlrP98156 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms