Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brca2P97929 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca2P97929 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brca2P97929 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brca2P97929 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca2P97929 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca2P97929 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca2P97929 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brca2P97929 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brca2P97929 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brca2P97929 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca2P97929 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Brca2P97929 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca2P97929 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brca2P97929 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca2P97929 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brca2P97929 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brca2P97929 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca2P97929 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms