Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smyd1P97443 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smyd1P97443 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smyd1P97443 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smyd1P97443 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1504 ms