Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmsP97355 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmsP97355 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmsP97355 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmsP97355 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SmsP97355 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmsP97355 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmsP97355 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmsP97355 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SmsP97355 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmsP97355 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmsP97355 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmsP97355 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmsP97355 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmsP97355 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmsP97355 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmsP97355 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmsP97355 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmsP97355 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmsP97355 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SmsP97355 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmsP97355 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmsP97355 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmsP97355 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SmsP97355 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SmsP97355 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SmsP97355 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SmsP97355 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SmsP97355 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SmsP97355 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SmsP97355 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SmsP97355 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SmsP97355 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SmsP97355 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SmsP97355 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SmsP97355 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SmsP97355 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SmsP97355 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SmsP97355 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SmsP97355 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SmsP97355 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SmsP97355 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SmsP97355 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SmsP97355 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SmsP97355 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SmsP97355 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SmsP97355 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SmsP97355 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SmsP97355 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SmsP97355 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SmsP97355 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SmsP97355 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SmsP97355 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SmsP97355 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SmsP97355 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SmsP97355 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SmsP97355 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SmsP97355 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SmsP97355 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SmsP97355 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SmsP97355 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SmsP97355 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SmsP97355 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SmsP97355 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SmsP97355 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SmsP97355 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SmsP97355 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SmsP97355 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SmsP97355 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SmsP97355 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SmsP97355 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SmsP97355 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SmsP97355 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SmsP97355 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SmsP97355 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SmsP97355 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SmsP97355 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SmsP97355 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SmsP97355 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmsP97355 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmsP97355 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmsP97355 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmsP97355 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SmsP97355 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmsP97355 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmsP97355 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SmsP97355 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SmsP97355 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SmsP97355 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SmsP97355 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SmsP97355 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SmsP97355 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmsP97355 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmsP97355 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmsP97355 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmsP97355 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmsP97355 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmsP97355 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmsP97355 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmsP97355 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms