Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhodP97348 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhodP97348 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhodP97348 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhodP97348 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhodP97348 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhodP97348 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhodP97348 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RhodP97348 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhodP97348 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhodP97348 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhodP97348 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhodP97348 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RhodP97348 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhodP97348 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhodP97348 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RhodP97348 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhodP97348 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhodP97348 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhodP97348 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhodP97348 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RhodP97348 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RhodP97348 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RhodP97348 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RhodP97348 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RhodP97348 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RhodP97348 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RhodP97348 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhodP97348 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhodP97348 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RhodP97348 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhodP97348 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhodP97348 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhodP97348 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RhodP97348 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RhodP97348 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RhodP97348 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhodP97348 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhodP97348 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhodP97348 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhodP97348 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhodP97348 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhodP97348 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhodP97348 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RhodP97348 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RhodP97348 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RhodP97348 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RhodP97348 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RhodP97348 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RhodP97348 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RhodP97348 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RhodP97348 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RhodP97348 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RhodP97348 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RhodP97348 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhodP97348 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhodP97348 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhodP97348 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhodP97348 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RhodP97348 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RhodP97348 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RhodP97348 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RhodP97348 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RhodP97348 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RhodP97348 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RhodP97348 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RhodP97348 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RhodP97348 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RhodP97348 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhodP97348 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RhodP97348 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhodP97348 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhodP97348 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RhodP97348 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhodP97348 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhodP97348 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhodP97348 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhodP97348 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RhodP97348 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhodP97348 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RhodP97348 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RhodP97348 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RhodP97348 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RhodP97348 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RhodP97348 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RhodP97348 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RhodP97348 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RhodP97348 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RhodP97348 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RhodP97348 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RhodP97348 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RhodP97348 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RhodP97348 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RhodP97348 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RhodP97348 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RhodP97348 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RhodP97348 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RhodP97348 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RhodP97348 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RhodP97348 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms