Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp8a1P70704 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp8a1P70704 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8a1P70704 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp8a1P70704 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8a1P70704 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms