Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema3eP70275 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema3eP70275 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema3eP70275 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema3eP70275 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema3eP70275 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema3eP70275 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema3eP70275 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema3eP70275 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema3eP70275 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema3eP70275 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sema3eP70275 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sema3eP70275 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sema3eP70275 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sema3eP70275 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema3eP70275 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms