Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl23P62830 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl23P62830 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms