Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrch1P62046 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrch1P62046 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrch1P62046 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrch1P62046 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrch1P62046 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrch1P62046 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrch1P62046 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrch1P62046 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrch1P62046 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrch1P62046 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrch1P62046 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrch1P62046 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrch1P62046 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrch1P62046 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrch1P62046 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrch1P62046 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171 ms