Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vbp1P61759 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vbp1P61759 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vbp1P61759 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vbp1P61759 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms