Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd6P61407 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd6P61407 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tdrd6P61407 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tdrd6P61407 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd6P61407 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms