Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snap25P60879 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap25P60879 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap25P60879 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap25P60879 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap25P60879 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snap25P60879 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snap25P60879 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snap25P60879 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snap25P60879 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snap25P60879 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snap25P60879 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Snap25P60879 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snap25P60879 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snap25P60879 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snap25P60879 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snap25P60879 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snap25P60879 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snap25P60879 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snap25P60879 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms