Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrn4P59383 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrn4P59383 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn4P59383 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn4P59383 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms