Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Csrnp3P59055 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Csrnp3P59055 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Csrnp3P59055 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Csrnp3P59055 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms