Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tlr8P58682 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tlr8P58682 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tlr8P58682 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tlr8P58682 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tlr8P58682 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tlr8P58682 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tlr8P58682 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tlr8P58682 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tlr8P58682 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tlr8P58682 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tlr8P58682 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tlr8P58682 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tlr8P58682 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tlr8P58682 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tlr8P58682 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tlr8P58682 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tlr8P58682 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tlr8P58682 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tlr8P58682 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tlr8P58682 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Tlr8P58682 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tlr8P58682 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tlr8P58682 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms