Protein–RNA interactions for Protein: P55302

Lrpap1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrpap1P55302 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrpap1P55302 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrpap1P55302 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrpap1P55302 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms